前作『银河旋风ブライガー』のラストで语られたカーメン・カーメンによる大アトゥーム计画（木星爆破による新惑星の大量创造）から600年、时代は28世纪を迎えていた。人类は地球轨道上に35の植民惑星を筑いて移り住み、星々は太阳系管理机构ドメスチック・バクーフ（モデルは幕府）によって统治されていた。しかし、メリーカ（モデルはアメリカ）・エンゲーレス（モデルはイギリス）・ランス（モデルはフランス）等の外宇宙舰队（异星人）との接触をきっかけにバクーフ统治体制の弱体化が露见、ロングー（モデルは长州藩）・ゴワハンド（モデルは萨摩藩）・トルサ（モデルは土佐藩）等の反体制派の惑星が台头するなど、太阳系は混迷を极めていた。そんなある日、伝説のJ9に憧れるドン・コンドールらは、太阳系で一旗上げるべく仲间达と共に「银河烈风队」を结成する。银河烈风队は、バクーフのリーダーである総将军アーウィン14世の护卫を务めたのをきっかけに、バクーフ特别警备队に组み込まれ、闇の武器商人スリーJから手に入れた巨大ロボット・バクシンガーを駆り、反バクーフ势力と戦う事になる。
